El propósito del SCAI es facilitar la recepción, almacenamiento y gestión eficiente de la información proveniente de los Planes de Auditorías Internas de las Entidades públicas, así como de los resultados de dichas auditorías; tanto las planificadas como las imprevistas. De esta forma promover la transparencia, la rendición de cuentas y la mejora  continua en el ámbito de las auditorías internas del sector público. 

Adicional a esto, llevar un control del Recurso Humano que labora en las Unidades de Auditoría Interna para la debida administración del personal que ha sido capacitado.